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Fiche personnelle de

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Julien. Bert
CHU-Brest

M. Julien BERT

COORDONNEES

LaTIM

  • LaTIM
  • Bâtiment 2bis (I3S)
    CHU Morvan - 5, Av. Foch
  • 29609 Brest CEDEX
  • Tel +33(0)2 98 01 8199

CHU-Brest

  • CHU-Brest
  • 29200 Brest

CV COURT

Julien Bert a étudié à l'université de Franche-Comté à Besançon où il fut diplômé avec mention d'une licence et d'une maitrise en électronique, automatique et électrotechnique, ainsi qu'en 2004 d'un DEA en informatique, automatique et productique. C'est à cette période qu'il commence ses travaux de recherche au CNRS Laboratoire d'Automatique de Besançon (LAB) en intelligence artificielle appliquée à la microrobotique coopérative. Quelques années plus tard en 2007, dans ce même laboratoire, il obtiendra avec mention le grade de docteur en automatique avec des travaux sur la synthèse de vue virtuelle en microscopie optique appliquée à la micromanipulation. Dans la période qui suit, il sera pendant trois ans postdoctoral fellow au Department of Biochemistry & Molecular Biology de la Houston Medical School, établissement nobélisé du Texas Medical Center de Houston. Ses travaux seront consacrés à la détermination de la structure 3D de protéine humaine par cryo-microscopie électronique tomographique. Actuellement Julien Bert est ingénieur hospitalier au CHRU de Brest et rattaché au Laboratoire de Traitement de l'Information. Ses travaux de recherche consistent à animer différents projets dans les domaines suivants : la simulation Monte-Carlo (physique des particules) pour des applications médicales, la reconstruction en tomographie d’émission et l’utilisation de système de calcul hybrides (CPU/GPU) pour un environnement clinique.



Publications

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2015  Bouzid D, Bert J, PF. Dupre, Benhalouche S, Pradier O, Boussion N, Visvikis D:Monte-Carlo dosimetry for intraoperative radiotherapy using a low energy x-ray source.. Acta Oncologica, 2015,,0-0,O,M,GB
2014  Visvikis D, Monnier F, Bert J, Hatt M, Fayad H:PET/MR attenuation correction: where do we come from and where are we going.. European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging, 2014,,0-0,L,M,GB
2013  Autret A, Bert J, Bahi Z, Strauss Olivier, Visvikis D:Accurate fully 3D list-mode PET reconstruction on Multi-GPUs.. Recherche en Imagerie et Technologies pour la Santé, 2013,,0-0,C,A,GB
  Lemaréchal Y, Bert J, Boussion N, Visvikis D:Amélioration de la planification du traitement en curiethérapie de prostate par simulation Monte-Carlo complète et rapide utilisant les processeurs graphiques.. 7èmes Journées du Cancéropôle Grand Ouest, 2013,,0-0,C,A,FR
  Lemaréchal Y, Bert J, Lefur Emmanuelle, Boussion N, Visvikis D:Amélioration de la planification du traitement en curiethérapie de prostate par simulation Monte-Carlo complète et rapide utilisant les processeurs graphiques.. Journée des doctorants et post-doctorants en biosanté de Bretagne, 2013,,0-0,C,A,FR
  Autret A, Bert J, Strauss Olivier, Visvikis D:Amélioration qualitative et quantitative de reconstruction TEP basée sur architecture graphique.. 7èmes Journées du Cancéropôle Grand Ouest, 2013,,0-0,C,A,FR
  Bouzid D, Visvikis D, Dupré Pierre-François, Bert J, Pradier O, Boussion N:Dosimetric validation of an Intrabeam™ GATE model, based on Monte Carlo GEANT4 toolkit, for IORT applications.. "The future of radiation oncology: Imaging, Dosimetry, Biology & Therapy" Workshop, 2013,,0-0,C,A,GB
  Bouzid D, Bert J, Dupré Pierre-François, Bert J, Pradier O, Visvikis D:Dosimetric validation of an Intrabeam™ GATE model, based on Monte Carlo GEANT4 toolkit, for IORT applications.. 55th AAPM Annual Meeting & Exhibition 2013, 2013,,0-0,C,A,GB
  Bouzid D, Bert J, Dupré Pierre-François, Pradier O, Visvikis D, Boussion N:Dosimetric validation of an Intrabeam™ GATE model, based on Monte Carlo GEANT4 toolkit, for IORT applications.. 7th Intrabeam User Meeting, 2013,,0-0,C,A,GB
  Autret A, Bert J, Strauss Olivier, Visvikis D:Fully 3D PET List-Mode reconstruction including an accurate detector modeling on GPU architecture.. International Meeting on Fully Three-Dimensional Image Reconstruction in Radiology and Nuclear Medicine, 2013,,0-0,C,M,FR
  Bert J, Hector Perez-Ponce, Ziad El Bitar, Sebastien Jan, Yannick Boursier, Damien Vintache, Alain Bonissent, Christian Morel, David Brasse, Visvikis D:Geant4-based Monte Carlo simulations on GPU for medical applications.. Physics in medicine and biology, 2013,58,5593-5611,R,M,GB
  Lemaréchal Y, Bert J, Lefur Emmanuelle, Boussion N, Visvikis D:GGEMS-brachy: Fully GPU GEant4-based Monte Carlo Simulation for brachytherapy applications.. "The future of radiation oncology" workshop Berder, 2013,,0-0,C,M,GB
  Lemaréchal Y, Bert J, Lefur Emmanuelle, Boussion N, Visvikis D:GGEMS-brachy: Fully GPU GEant4-based Monte Carlo Simulation for brachytherapy applications.. Geant4 2013 International User Conference, 2013,,0-0,C,M,GB
  Lemaréchal Y, Bert J, Lefur Emmanuelle, Boussion N, Visvikis D:GGEMS-brachy: Fully GPU GEant4-based Monte Carlo Simulation for brachytherapy applications.. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference, 2013,,0-0,C,M,GB
  Benhalouche S, Bert J, Visvikis D, Pradier O, Boussion N:Imagerie en Megavolt Cone-Beam Computed Tomography MV CBCT 6 MV : Simulation et évaluation GATE v6.2 Monte Carlo d’un imageur portal avec application spécifique en ORL.. SFPM: Société française de Physique Médicale 2013, 2013,,0-0,A,M,FR
  Benhalouche S, Bert J, Autret A, Visvikis D, Pradier O, Boussion N:Imaging and Radiation Therapy: GATE Monte Carlo Simulation of a Megavolt Cone Beam CT .. IEEE/NSS/MIC/RTSD, 2013,,0-0,C,M,GB
  Benhalouche S, Bert J, Visvikis D, Pradier O, Boussion N:Imaging and radiation therapy: GATE Monte Carlo simulation of a MV-CBCT flat panel with specific application in head and neck cancer... AAPM 55th Annual Meeting&Exhibition, 2013,,0-0,C,M,E
  Benhalouche S, Bert J, Autret A, Visvikis D, Pradier O, Boussion N:Imaging and radiation therapy: GATE Monte Carlo simulation of a MV-CBCT flat panel with specific application in head and neck cancer... "The future of radiation oncology" workshop, 2013,,0-0,C,M,GB
  Autret A, Bert J, Strauss Olivier, Visvikis D:Incorporation of Time-of-Flight information in PET List-Mode reconstruction using a projector with accurate detector PSF modeling.. IEEE/NSS/MIC/RTSD, 2013,,0-0,C,M,GB
  Bouzid D, Boussion N, Bert J, Pradier O, Visvikis D:Modélisation et validation sur Monte Carlo d’un traitement de métastases vertébrales sur fantôme par Kyphoplastie et RT peropératoire (Kypho-IORT)... 52èmes Journées Scientifiques de Physique Médicale SFPM, 2013,,0-0,C,A,FR
  Bouzid D, Bert J, Dupré Pierre-François, Benhalouche S, Pradier O, Visvikis D, Boussion N:Monte Carlo simulation of the INTRABEAM ® system with the platform GATE for breast cancer... DEGRO 2013 – 19th Annual Congress, 2013,,0-0,C,A,GB
  Bert J, Lemaréchal Y, Boussion N, Visvikis D:New particle navigator for hybrid voxelized/analytical phantoms in Monte Carlo simulations for medical applications.. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference, 2013,,0-0,C,M,GB
  Bouzid D, Boussion N, Dupré Pierre-François, Bert J, Pradier O, Visvikis D:Personalized 3D dose prediction for Intrabeam™ treatments based on patient CT imaging with Monte Carlo GATE simulations.. Geant4 2013 International User Conference, 2013,,0-0,C,A,GB
  Bouzid D, Boussion N, Dupré Pierre-François, Bert J, Pradier O, Visvikis D:Personalized 3D dose prediction for Intrabeam™ treatments based on patient CT imaging with Monte Carlo GATE simulations.. "The future of radiation oncology: Imaging, Dosimetry, Biology & Therapy" Workshop, 2013,,0-0,C,A,GB
  Bouzid D, Boussion N, Dupré Pierre-François, Bert J, Pradier O, Visvikis D:Personalized 3D dose prediction for Intrabeam™ treatments based on patient CT imaging with Monte Carlo GATE simulations.. 55th AAPM Annual Meeting & Exhibition 2013, 2013,,0-0,C,A,GB
  Bouzid D, Boussion N, Dupré Pierre-François, Bert J, Pradier O, Visvikis D:Personalized 3D dose prediction for Intrabeam™ treatments based on patient CT imaging with Monte Carlo GATE simulations.. 7th Intrabeam User meeting, 2013,,0-0,C,A,GB
  Bouzid D, Bert J, Dupré Pierre-François, Benhalouche S, Visvikis D, Pradier O, Boussion N:Simulation Monte Carlo du système Intrabeam® avec la plateforme GATE (Geant4) pour le cancer du sein... 7èmes Journées du Cancéropôle Grand Ouest, 2013,,0-0,C,M,FR
  Bouzid D, Bert J, Dupré Pierre-François, Benhalouche S, Pradier O, Visvikis D, Boussion N:Simulation Monte Carlo du système Intrabeam® avec la plateforme GATE (Geant4) pour le cancer du sein... 52èmes Journées Scientifiques de Physique Médicale , 2013,,0-0,C,A,FR
  Bouzid D, Bert J, Dupré Pierre-François, Benhalouche S, Visvikis D, Pradier O, Boussion N:Simulation Monte Carlo du système Intrabeam® sur GATE et application au cancer du sein... journée des doctorants et post-doctorants en biologie-santé en bretagne edition 2013, 2013,,0-0,C,M,FR
  Lemaréchal Y, Bert J:Simulation Monte Carlo rayonnement/matière sur GPU appliquée à la curiethérapie.. Ecole d'été francophone de traitement d'image sur GPU, 2013,,0-0,C,M,FR
  Lemaréchal Y, Bert J, Boussion N, Visvikis D:SU-C-500-03: GGEMS-Brachy: Fully GPU Geant4-Based Efficient Monte Carlo Simulation for Brachytherapy Applications.. AAPM annual meeting, 2013,40,88-88,C,M,GB
  Wentz T, Fayad H, Bert J, Boussion N, Pradier O, Visvikis D:Suivi du mouvement respiratoire externe avec une caméra temps-de-vol : application pour la prédiction de la déformation interne.. Recherche en Imagerie et Technologies pour la Santé, 2013,,0-0,C,M,FR
2012  Wentz T, Fayad H, Bert J, Pradier O, Clement JF, Boussion N, Visvikis D:Accuracy of dynamic patient surface monitoring using a Time-of-Flight camera and B-splines modeling for respiratory motion characterization.. Physics in Medicine and Biology, 2012,57(13),4175-4193,O,M,GB
  Bahi Z, Bert J, Autret A, Visvikis D:High Performance Multi-GPU Acceleration for Fully 3D List-Mode PET Reconstruction.. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference Record (NSS/MIC)ce, 2012,,3390-3393,C,A,GB
  Bert J, Perez-Ponce H, Jan S, El Bitar Z, Gueth P, Cuplov V, Chekatt H, Benoit D, Sarrut D, Boursier Y, Brasse D, Buvat I, Morel C, Visvikis D:Hybrid GATE: A GPU/CPU implementation for imaging and therapy applications.. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference, 2012,,2247-2250,C,A,GB
  Bouzid D, Bert J, Benhalouche S, Pradier O, Visvikis D, Boussion N:Monte Carlo simulation on GATE V6.1 of an intraoperative device Intrabeam™ for early breast cancers... 6th Intrabeam User's meeting , 2012,,0-0,C,A,GB
  Autret A, Bert J, Strauss O, Visvikis D:Projector with Realistic Detector Scatter Modelling for PET List-Mode Reconstruction.. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference, 2012,,3333-3336,C,A,GB
  Bouzid D, Bert J, Dupré Pierre-François, Benhalouche S, Pradier O, Visvikis D, Boussion N:Simulation Monte Carlo du système Intrabeam® avec la plateforme GATE pour le cancer du sein... 23ème congrès national de la Société Française de Radiothérapie Oncologique (SFRO), 2012,,0-0,C,A,FR
  Bouzid D, Bert J, Dupré Pierre-François, Benhalouche S, Pradier O, Visvikis D, Boussion N:Simulation Monte Carlo du système Intrabeam® avec la plateforme GATE pour le cancer du sein... 2ème JOURNEE DES DOCTORANTS DE L'ED SICMA , 2012,,0-0,C,A,FR
  Wentz T, Fayad H, Bert J, Boussion N, Visvikis D:Utilisation d'une camera TOF pour la synchronisation et la modélisation du mouvement respiratoire.. Journées scientifiques Nouvelles méthodologies en imagerie du vivant, 2012,,0-0,C,M,FR
2011  Bert J, Visvikis D:A Fast CPU/GPU Ray Projector for Fully 3D List-Mode PET Reconstruction.. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference, 2011,,4126-4130,C,M,GB
  Perez-Ponce H, El Bitar Z, Boursier Y, Vintache D, Bonissent A, Morel C, Brasse D, Visvikis D, Bert J:Implementing Geant4 on GPU for Medical Applications.. IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference, 2011,,2703-2707,C,M,GB
2010  Dembélé S, Bert J, Tamadazte B, Lefort-Piat N:A Trifocal Transfer Based Virtual Microscope for Robotic Manipulation of MEMS Components.. International Journal of Optomechatronics, 2010,4,342-361,R,M,GB
2008  Dembélé S, Bert J, Lefort-Piat N:Novel View Synthesis by Trifocal Tensor: Improvement of View Placement and Application to Microassembly.. Mali Symposium on Applied Sciences, 2008,,0-0,C,A,GB
2007  Bert J, Dembélé S, Lefort-Piat N:Performing Weak Calibration at the Microscale. Application to Micromanipulation.. IEEE International Conference on Robotics and Automation, 2007,,4937-4942,C,A,GB
2006  Bert J, Dembélé S, Lefort-Piat N:Synthesizing a Virtual Imager with a Large Field of View and a High Resolution for Micromanipulation.. Proceedings of International Workshop on Microfactories (IWMF), 2006,,0-0,C,A,GB
  Bert J, Dembélé S, Lefort-Piat N:Toward the Vision Based Supervision of Microfactories Trough Images Mosaicing.. International Precision Assembly Seminar, 2006,239,250-250,C,A,GB
  Bert J, Dembélé S, Lefort-Piat N:Trifocal Transfer Based Novel View Synthesis for Micromanipulation.. Lecture Notes in Computer Science, 2006,4291,411-420,R,M,GB
  Bert J, Dembélé S, Lefort-Piat N:Vers la Supervision de Microfactories par Mosaicing d'Images.. Atelier du Laboratoire Européen Associé, 2006,,0-0,A,A,FR
  Bert J, Dembélé S, Lefort-Piat N:Virtual Camera Synthesis for Mircomanipulation and Mircoassembly.. IEEE International Conference on Intelligent Robots and Systems, 2006,,1390-1395,C,A,GB
2005  Bert J, Dembélé S, Lefort-Piat N:Synthèse de Microimageurs Virtuels pour la Micromanipulation.. Atelier du Laboratoire Européen Associé, 2005,,0-0,A,A,FR

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